Koszt zabiegu mezoterapii zależy od kilku czynników, takich jak rodzaj stosowanego preparatu, obszar zabiegowy oraz lokalizacja kliniki. W przypadku twarzy ceny zaczynają się zazwyczaj od 300-500 zł za jedną sesję, ale w przypadku użycia specjalistycznych preparatów lub większego obszaru cena może wzrosnąć do 800-1000 zł. Przy mezoterapii na ciało, ceny mogą sięgać 1000-1500 zł za jeden zabieg.
Cena w dużej mierze zależy od użytego preparatu. Na przykład koktajle witaminowe są tańsze, a preparaty z kwasem hialuronowym, peptydami czy czynnikami wzrostu mogą być droższe, ponieważ mają bardziej zaawansowane działanie.
Choć wykonanie serii zabiegów wiąże się z wyższymi kosztami, wiele klinik oferuje zniżki przy zakupie pakietu kilku sesji. Seria 3-6 zabiegów może kosztować od 1000 do 5000 zł, w zależności od preparatów i obszaru zabiegowego.
Droższe preparaty, takie jak te zawierające czynniki wzrostu, są polecane w przypadku głębszych zmarszczek, widocznych oznak starzenia lub regeneracji skóry po intensywnym wysuszeniu. Dają one bardziej zauważalne i trwałe efekty.